客户的虚拟主机网站漏洞的修复方法：

1.检查是否有账号泄露的情况以及有没有异常登录。

2.检查系统补丁是否更新到最新版。

3.网站文件下载到本地，利用安全扫描软件扫描网页后门木马，清理网页后门木马。

4.关闭危险端口，开启系统防火墙。

5.更新网站文件覆盖可疑或者被修改过的文件。